吴之荣曾任归安知县，后因事罢官，想以告讦为功谋求复官，于是首告庄廷鑨刊印《明史》中多指斥清代语，将这件事情告诉将军松魁，松魁把案件交给巡抚朱昌祚处理。这些人接受了庄允诚数千金的贿赂，拒不审理。庄允诚将其中被告发的句子改掉后，继续刊刻发行。

吴之荣的阴谋没有得逞，于是特意买到了最初的刊印本，上告到法司。康熙二年（1663），刑部侍郎审理诉讼、咨询案情，这就是《明史》文字狱。当时庄廷鑨已死，将他的尸体挖出来斩辱、戮尸，杀了他的弟弟庄廷钺。

《明史辑略》序中称这本书的原稿为朱氏所写，这里的朱氏是指明代宰相朱国桢，而吴之荣因为怨恨南浔富人朱佑明，于是嫁祸他，说这本书中所说的朱氏就是朱佑明，并杀了他的五个儿子。

明史案死于狱中的人有七十余人，《明史》文字狱后，吴之荣便被起用，并把没收的朱佑明的家产给了他，后官至右金都御史。