2011年3月11日发生东日本大地震，此站遭地震引发的海啸冲毁，且因位于福岛第一核电厂事故方圆20公里警戒区之内，而停止营业。2013年3月24日之后，因放射线剂量降低，车站一带改列为避难指示解除准备区域，不再管制人员进出，但仍禁止夜宿。JR东日本与当地自治体已有共识，在防波堤等防海啸设施建设完成后，原地重建车站以恢复铁路交通，现车站已经于2020年3月重新开业。

2017年10月21日，富冈车站与龙田车站间的重建工程以及除污作业完工，恢复铁路交通。

2020年3月14日，富冈车站至浪江车站间路段恢复列车运行。