上述三局各课的主要工作如下：

运输局

计划课 干部管理、行车人员计划、行车设备（不包括行车安全设备）、运转成绩的调查以及本局所管工作的路外委托等。

列车课 列车运行图、机车牵引定数、列车运转时分、车站作业级调度工作。

保安课 行车有关规章、信号规章、行车事故、行车干部考核、行车安全设备及铁道气象通报等。

车务课 机车及货车的运用及配属、货车检修、货车清扫、路外单位车辆直通、机车乘务员的运用教育及考核。（包括电动车组和内燃动车组）等。

旅客局

总务课 客运营业、旅客及行李收入、旅客运价及手续费、客车乘务员运用、路外单位车辆直通及车站、栈桥的共用等。

开发计划课 客运远期营业方针、客运设备计划及投资、经济动向及旅客运输调查、市场调查、旅游调查等。

营业课 旅客运输计划、客车（不包括行李车）及附属品的配属运用及租用、电车及内燃动车组的配属和运用、团体运输、旅客服务、客运营业贩卖及宣传等。

行李课 行李运输计划、行李车及附属品的配属运用及租用、行李运费、行李运输宣传及清扫等。

中央贩卖中心 利用电子计算机处理坐席预约业务，编制列车资料以及贩卖情报的处理等。这一机构不设在本社内，而设在东京附近国立站的电子计算中心。

货物局

总务课 货物营业计划、货物收入、货物运价和手续费、衡器管理等。

输送课 货物运输计划、货物列车编组计划、货车（包括集装箱）配属、运用和租用以及货车附属品的管理和应用、货运设备及投资、货车及货物运送用具计划、货运情报处理等。

营业课 货运营业、专用线、有关搬运和仓库保管、货场、集装箱业务及货运清扫业务等。

调查开发课 货运远期营业方针、经济动向及物资流通的调查、市场调查、临海工业区及内陆工业地带的货运营业政策等。

管道运输室 管道运输、管道建设计划、管道运输技术、管道运输管理等。

国铁巴士（国鉄バス）（由日本国有铁道自动车局经营）

若有线路被水体隔绝时，则以联络船（实际上就是火车渡轮）作为连接方式。

主词条：日本国铁分割民营化

由于负债等经营问题，1986年（昭和61年）11月28日，日本国会参议院大会通过《日本国有铁道改革法》，决定将日本国铁分割民营化，设立由日本政府出资的JR集团和日本国有铁道清算事业团。

其中，日本国有铁道清算事业团负责承担日本国铁的清算事务，并且是最初持有整个JR集团全部股份的特殊法人；而至于JR集团，人们常将它与日本国铁视作两个独立的事业体。

这次日本国铁分割民营化由日本中曾根康弘内阁实施，是中曾根内阁自1986年开始进行的政治改革中的一部分，同时也是由日本自由民主党所推动的一连串民营化改革中的一部分。1982年（昭和57年），自民党籍的中曾根康弘就任日本首相后，便开始大力推行将公共事业民营化；而攸关社会民生产业的电电公社、日本国铁及专卖公社三个“公共企业体”（又称“三公社”），则被列为民营化的首要目标。

1985年（昭和60年）4月1日，电电公社与专卖公社率先进行民营化，而日本国铁最终也于1987（昭和62年）年4月1日依照《日本国有铁道改革法》被分割民营化，成为如今的JR集团。

此外，在这次日本国铁分割民营化的过程中，运输大臣三冢博充分展示了他的才能。

①铁道通信于1989年5月1日与日本电讯合并，现已并入软件银行电讯。

②新干线铁道保有机构于1991年10月1日解散，曾先后改组为铁道整备基金与运输设施整备事业团，现为铁道建设运输施设整备支援机构的一部分。

③日本国有铁道清算事业团于1998年10月22日解散，成为日本铁道建设公团属下的国铁清算事业本部；日本铁道建设公团于2003年10月1日解散后，国铁清算事业本部的业务被并入铁道建设运输施设整备支援机构。