不仅如此，义满还通过削弱势力过大的守护大名来集中权力。元中四年/嘉庆元年（1387年），幕府创业功臣，美浓、尾张、伊势守护土岐赖康去世，其侄子兼养子土岐康行继位。义满借机挑动土岐氏内乱。于康应元年/元中六年（1389年）下达了对土岐康行谋反的追讨令。被逼上梁山的土岐康行在美浓池田战败，丧失了权势。康行的领国全被没收。总领移至康行叔父土岐赖忠，封得美浓守护，尾张则封给了康行之弟土岐满贞，土岐氏被严重削弱。而义满的下一个目标，就锁定在了“六分之一殿”山名氏身上。

山名氏的内讧

山名师义于天授二年/永和二年（1376年）去世，由于继承者尚幼，就将总领传给了末弟山名时义。而对于此事，山名氏清和山名满幸表现出了不满。康应元年/元中六年，山名时义去世，把总领和但马、备后守护之位传给了儿子山名时熙，伯耆传给了养子山名氏之。然而，此时作为病弱的山名义幸（山名师义长男）的代官出仕于幕府的山名满幸感到自己被无视，心中的不满渐渐加深。

明德元年/元中七年（1390年）三月，足利义满以山名时义生前对将军不逊，山名时熙、氏之兄弟对将军不敬为借口，向山名氏清和山名满幸下达了对时熙、氏之兄弟的追讨令。时熙、氏之兄弟被迫举兵，山名氏清攻击时熙本据地但马，山名满幸攻击氏之本据地伯耆。第二年，时熙、氏之兄弟战败。战后论功，氏清得到了但马、山城，满幸得到了伯耆。备后则由满幸之兄山名义熙继承（同年被细川赖之替下）。

山名氏分裂后，虽然时熙、氏之被追放，但氏清、满幸的实力却极度膨胀。但是，足利义满通过巧妙的手法，成功的挑起了战争。

元中八年/明德二年（1391年），逃亡中的时熙、氏之兄弟潜伏到京都清水寺求见足利义满，请求赦免。很快，义满想赦免其罪行，并恢复其领地的消息四处传开。这使得山名氏清极度不安，同年十月以生病为借口拒不出席义满在宇治举行的红叶赏。此年三月，义满罢免斯波义将管领之职，由细川赖之养子细川赖元继任，蛰伏于四国的细川赖之被赦免上洛。这一切据推测是足利义满想打倒参加康历政变和土岐康行之乱而势力膨胀的斯波派的做法。

同年十一月，山名满幸强夺后圆融天皇的御料地出云国仙洞领横田庄。足利义满以此为借口下达御教书，剥夺满幸出云守护职，命其来京都谢罪。愤怒的满幸来到了岳父氏清的领国和泉堺港，向其说道：“最近将军殿下的做法，是要灭我山名氏啊！（昨今の将军のやり方は、山名氏を灭ぼすつもりである）”。最终，山名氏清在堺港起兵，决定一举攻上京都，山名满幸则返回领国丹波起兵呼应岳父。并且，山名氏清成功说得兄长纪伊守护山名义理举兵。为了获得大义名分，氏清投向南朝，获得锦御旗。

12月19日，幕府在丹后和河内的代官向幕府报告了山名氏清和山名满幸起兵的消息，但幕府重臣半信半疑。直到氏清的侄子山名氏家（因幡守护，山名氏冬之子）与氏清合流，京都发生骚动后，才明确山名氏谋反的消息。

12月25日，足利义满召集众臣召开军事会议，重臣间发出了与山名氏和解的声音。然而挑拨氏清和满幸举兵的义满早已有了必胜的把握，“本家的命运和山名氏的命运就在此战，看上天眷顾哪边吧。（当家の运と山名家の运とを天の照覧に任すべし）”，义满斥退了和解论者，决定开战。

次日，幕府军进至旧平安京的大内里内野处迎击山名军，义满亲率御马回五千骑坐镇堀川后的一色邸处。

山名军将决战之日定在了12月27日，山名氏清率3000骑从堺港，山名满幸率2000骑从丹波出发，相继向京都进军。由丹波进军的满幸于26日到达内野三里之外的山峰布阵。但是，山名氏清军受到了河内守护代游佐国长的阻击，于29日才到达淀川，并且部队中不断出现向幕府投降的逃兵，士气极其低落。

12月29日，迟到的氏清军由淀川的中岛兵分三路向京都进军，满幸也兵分三路向京都进击，由于在黑夜中进军，各部联系极其混乱。

30日晨，山名军将领山名义数、小林上野介所率的七百骑攻击二条大宫，与大内义弘以下的三百骑展开激战。大内军先下马射箭袭扰山名军，被激怒的山名军发动莽撞突击，被四面埋伏的大内军以混战战术击溃，小林上野介被斩杀，山名义数亦战死乱军之中，幕府军旗开得胜，大内义弘受义满太刀赏赐。

接着，山名满幸的主力两千骑也傻乎乎地投入到了内野的战场中，与田山等人激战，被死死拖住。关键时刻，足利义满将手下五千“御马回”投入战场，满幸军全线溃败，其人逃往丹波。

山名氏清率残余的两千人马，兵分两路发动了最后攻势，大内和赤松军抵挡不住，节节败退，前往援助的山名时熙五十骑郎党，被氏清杀得只剩八骑。传令兵接二连三向义满告急，义满认为决定性出击的时刻已到，便命预备队斯波军和一色军投入战场，本人也亲自打着将军旗号，出马迎敌。幕府士众见将军亲临，高呼万岁，山名军则抱头鼠窜——氏清回天乏力，企图逃亡，结果被一色诠笵团团包围，力战被杀。

内野之战，幕府方战没将士二百六十，击杀山名叛军八百七十九名，一日取得完胜。

明德三年/正中二年（1392年）正月，足利义满论功行赏。畠山基国受封山城，细川赖元受封丹波，一色满笵受封丹后，赤松义则受封美作，大内义弘受封和泉、纪伊，山名时熙受封但马，山名氏家受封因幡（战后降伏，被足利义满赦免罪行），山名氏之受封伯耆，京极高诠受封出云、隐岐。原先占据山阴十一国的庞然大物山名，此时沦落到了只保留三国的境地。此后足利义满大幅加强直辖军“马回”（奉公众）的实力，向世人昭示了将军绝对的权威。

同年二月，山名义理受到大内义弘的攻击而没落。应永二年（1395年），在九州筑紫剃发出家的山名满幸被捕，送往京都斩首。

明德三年（1392年），明德和议达成，南朝后龟山天皇向北朝投降，南北朝最终统一。

应永六年（1399年），足利义满挑拨大内义弘造反，将其剿灭（应永之乱），最终巩固了将军的绝对权力。

本次战乱被详细的记载在了《明德记》里，本书是与《太平记》同一流派的军记物语作品。著者不详，全三卷，以幕府方的视点写成。