1941年—1947年，在北京胡同里开办妇科诊所。

1948年，北京协和医院复办，任院妇产科主任。

1953年，任北京市妇女联合会副主席。

1955年，当选为中国科学院学部委员（院士）。

1958年，组织并开展对北京市部分地区妇女的癌瘤普查。

1959年，先后任北京妇产医院院长、中国医学科学院副院长、中国人民政治协商会议北京市委员会副主席。

1965年，参加中国医学科学院组织的巡回医疗队到湖南湘阴县农村巡回医疗。

1972年，跟随中国代表团出访美国、加拿大。

1974年，先后出访瑞士、法国、伊朗等。

1976年，深入地震第一线参加抗震救灾工作。

1978年，跟随中国代表团出访西欧四国；并当选第四届中华全国妇女联合会副主席。

1983年4月22日逝世于北京，享年82岁。

林巧稚早年从事胎儿宫内呼吸的研究对滋养细胞肿瘤发生及发展规律、女性盆器结核的发生及其治疗进行了深入研究，并进行了大量科普宣传和妇幼保健工作。林巧稚为了降低中国新生婴儿死亡率，防治妇女宫颈癌，她撰写了妇幼卫生科普通俗读物《家庭卫生顾问》等书；为了治疗新生儿溶血症，创造出用脐静脉换血的医疗方法；开辟了产科、妇科、妇科肿瘤、生殖内分泌、计划生育等妇产科学的亚专业。

林巧稚著有《妇科肿瘤病学》《妇科学进展》等；主编有《家庭育儿百科全书》等。其他论著部分参考如下：

[1]林巧稚.用造袋术治疗腹壁囊肿一例[J].中华医学杂志，1930，16．

[2]林巧稚.乙酰胆碱在正常分娩机制中的作用[J].中华生理学杂志，1949，17．

[3]林巧稚，连利娟，唐敏一.从病理检查和尿绒毛性腺激素定量试验讨论子宫绒毛膜,上皮癌的预后[J].中华妇产科杂志，1957，2：128．

[4]林巧稚，连利娟.24例良性葡萄胎及恶性葡萄胎转移的研究[J].中华妇产科杂志，1963，9：271．

[5]林巧稚，连利娟．恶性葡萄胎85例诊断及预后的探讨[J].中华妇产科杂志，1964，10：370．

[6]林巧稚.避孕、人工流产和输卵管结扎术的几个问题[J].人民军医，1964，5：32-27．

20世纪50年代，林巧稚筹建了北京妇产医院。

1946年—1948年，林巧稚在北京大学医学院兼课。

林巧稚为中国妇产科学界培养了一代又一代接班人，如妇产科专家郎景和院士，妇女保健学专家严仁英教授，北京协和医院妇产科主任医师连利娟教授，妇产科专家叶惠方教授等。

林巧稚出生在福建鼓浪屿的一个教员家庭，父亲林良英曾留学新加坡，教女儿英文和先进思想。在林巧稚5岁的时候，母亲就因患子宫癌病故。

“林巧稚是中国妇女界杰出的代表，她的成就是中国妇女的骄傲，为中国妇女解放事业作出了重要贡献。”（全国政协原副主席康克清评）

“林巧稚是中国妇产科学的开拓者和奠基人。”（北京大学校史馆评）

“林巧稚是中国妇产科的奠基人之一，是‘卓越的人民医学家’。”（《中国青年报》评）

“林巧稚不仅医术高明，她的医德、医风，奉献精神更是有口皆碑。她看淡荣誉，乐于奉献，并一直以‘奉献’作为自己的使命，她是人们心中真正的英雄。”（人民政协网评）

““她（林巧稚）是一团火焰、一块磁石。她的为人民服务的一生，是极其丰满充实地度过的。”（作家冰心评）

取名“毓园”的林巧稚纪念馆位于鼓浪屿东南部复兴路，是厦门市人民政府为纪念妇产科专家林巧稚而建。园中屹立着林巧稚的汉白玉雕像，建有“林巧稚大夫生平事迹展览室”。2016年，林巧稚纪念馆由全国妇联授予全国妇女爱国主义教育基地。

2004年，天津美术学院副教授艾得胜为国家博物馆创作林巧稚蜡像。2005年，林巧稚蜡像获得了国家博物馆一等奖。

1990年10月10日，邮电部发行了以林巧稚为题材的纪念邮票。林巧稚邮票为《中国现代科学家（第二组）》纪念邮票4枚中的第1枚。邮票画面上背景中那幅胎儿将产图，蕴含着对这位“生命使者”的真挚赞誉。

2012年，中国妇产科医师奖—“林巧稚妇产科医师奖”，经中国医师协会批准设立。2014年，“中国妇产科医师奖”修改名称为“妇产科好医生—林巧稚杯”。该奖项是中国妇产科领域的最高荣誉，从全国20万余妇产科医生中推选产生，奖励为中国妇产科事业做出贡献的医学工作者。

2021年7月17日，越剧现代戏《林巧稚》在福州芳华剧院上演。该剧旨在以越剧的艺术形式展现和弘扬福建女儿—林巧稚心系祖国、献身医学的品质和担当精神。