秦统一后，建立了一套以丞相为核心的中央官僚体制，其主要职官是丞相、太尉、御史大夫。丞相是百官之长，其职责是协助皇帝处理全国政务。所谓“相国、丞相，皆秦官，金印紫绶，掌丞天子，助理万机”。太尉，负责管理军事，“金印紫绶，掌武事”，“为百官之长”。御史大夫，其位次略次于丞相，是丞相的辅佐。《汉书·百官公卿表》：“御史大夫，秦官，位上卿，银印紫绶，掌副丞相。”在秦代，掌司法是御史大夫的主要职掌。御史大夫并不受制于丞相，而是直接受命于皇帝。

秦朝在全国范围内普遍推行郡县制。《史记·秦始皇本纪》云：“二十六年……秦初并天下……皆为郡县……分天下以为三十六郡。郡置守、尉、监。”后又在今河套地区建九原郡，在两广地区设南海、桂林、象郡三郡，共四十郡。郡下设县，《汉书·百官公卿表》“县大率方百里，其民稠则减，稀则旷，乡、亭亦如之，皆秦制也。”郡的最高行政长官为郡守。秦统一全国后，各郡均设守以掌其民。《汉书·百官公卿表》曰：“郡守，秦官，掌治其郡，秩二千石。”县的最高行政长官是县令、长。《汉书·百官公卿表》：“县令、长，皆秦官，掌治其县。万户以上为令，秩千石至六百石；减万户为长，秩五百石至三百石。”县制在秦代已基本定型，并成为我国两千年来帝制社会一种固定的地方行政区划。