弘治三年（1490）进士，授监察御史。巡按江西，弹劾怙势骄纵的镇守太监董让。

弘治十六年（1503），升任山东按察副使，整饬临清兵备。外夷前来朝贡，私自贩盐被发现，王哲请求没收而返其直，人称柔远得体。

正德三年（1508），升任广东按察使

正德四年（1509），升任南京都察院右佥都御史，管理操江。

正德五年（1510），改任都察院右佥都御史，巡视江西。历任江西巡抚。宁王朱宸濠阴谋叛乱，贿赂官吏，厌恶王哲不归附自己，于是在宴会上下毒，王哲得疾。

正德六年（1511），因疾归乡。

正德八年（1513）九月，卒。