石灰藻具有分泌或沉积钙质功能。以红藻门的管孔藻科（Solenoporaceae）和珊瑚藻科、绿藻门的伞藻科(亦称“粗枝藻科”、“轮状管藻科”Dasycladaceae)及轮藻门为最重要。整个植物体或某些器官都容易成为化石，与某些石灰岩和礁体的造成有密切关系。此外，绿藻门的伞藻科（Ac－etabulariaceae）也是热带系的石灰藻。绿藻与红藻都发现了化石，特别是伞藻科发达于古生代。红藻的筒孔藻属（Solenopora）和绿藻的杆孔藻属（Rhab－doporella）是奥陶纪的藻类，后者已呈现出复杂的形态结构。