以其兄章宗瀛编修官京师，遂入大兴籍。乾隆五十一年（1786）大兴籍举人，以对策博瞻发科。

益好学，积十余年，采获经史群籍传注，自言“辑书虽不由性灵，而学问日以进，吾为此事久之亦能为古文为骈体文矣”。又以今世所存古书版本多经宋明人删改，每恨曩时辑录已佚之书不录见存诸书以订正异同文字，盖古书多亡于北宋，故辑佚始于王应麟。

辑录唐宋以来亡佚古书，撰《隋书经籍志考证》，脱稿后不久，书稿被仇家所焚，仅存史部5卷。后有姚振宗著《汉艺文志考证》、《隋经籍志考证》，能订宗源之失。

生平辑佚书甚多，书稿未及刊行，辗转落入马国翰之手，马氏刊有《玉函山房辑逸书》594种。

（补者按：马国翰攘夺章宗源书稿刊刻之说曾一度流行，业经王重民先生等辩证，近来学者多不从之。）