它常常是泥晶灰岩或其他类型灰岩通过重结晶形成的，按晶粒的大小可细分为粉晶石灰岩、细晶石灰岩、粗晶石灰岩等，无裂隙或溶洞者可成为阻止油气逸散的良好盖层。该标本为细晶灰岩，由中国地质大学教工采集，中国地质大学博物馆1982年收藏,采自吉林洮安石炭系石灰岩中。

大部分结晶灰岩都是原生石灰岩经成岩重结晶作用改变了原生颗粒组分和生物粘结组分而形成的。因此，大部分结晶灰岩就是重结晶灰岩。重结晶灰岩可以不同程度的保留变余的原始结构特征。

结晶灰岩也有原生的，如大陆地表泉水、岩洞或河水由蒸发作用形成的石灰华和泉华。石灰华是一种致密的带状钙质沉淀物。通常呈不规则块状构造的钟乳石和石笋，发育有从溶液中依次沉淀的方解石或文石晶体所组成的皮壳状纹层。多产出于石灰岩洞穴表面。钙泉华专指地表上海绵状多孔疏松的方解石或文石晶体沉淀物。多呈树枝状、放射状或半球状等构造特征，内部常保留有植物茎、叶的痕迹。产出于温泉、裂隙水出露的地表。