康熙六年，擢左副都御史。七年，出为山西陕西总督。陕西饥，平凉、临洮、巩昌、西安、延安、凤翔、汉中、兴安诸府州多逋赋，有司令现户均输，民苦之，奏请蠲免。迭疏清釐加派、火耗诸弊。八年，辅政大臣鳌拜获谴，法司以莫洛附于鳌拜，请求逮问。圣诏以能任事，宽贷勿治，仍留任。九年，计典，仍以前罪夺职。陕西之民籥（yue）留。甘肃巡抚刘斗同，甘肃提督张勇、柏永馥等疏言莫洛清正，在官有善政，乞留以慰民望。上谕：“简用督抚，原以绥辑地方，爱养百姓。莫洛既能得民，其免处分，供职如故。”俄擢刑部尚书。十三年，吴三桂等奏请撤藩，上敕廷臣议，皆主勿徙，惟莫洛与米思翰、明珠议撤。吴三桂反叛，四川提督郑蛟麟等叛应之。二月，命莫洛经略陕西，拜武英殿大学士，仍管兵部，赐以敕印，既至，策遣诸军征四川。郑蛟麟兵据广元县百丈关，莫洛遣都统马一宝、将军席卜臣赴汉中，副都统科尔宽赴广元，击贼。十月，郑蛟麟将何德成犯宁羌，为官军所败，还奔四川，莫洛因遣提督王辅臣驻其地。逾月，郑蛟麟将彭时亨复据七盘、百丈诸关，劫略阳粮艘，截陆运栈道。广元军缺饷两月矣，总兵王怀忠所部溃散，而王辅臣亦阴怀异志。辅臣故与莫洛有郄，奉檄使随征，益怏怏，藉口戎备寡，莫洛益以骑兵二千，少之；又以马疲瘠不任用摇军心，军无斗志。十二月，莫洛至宁羌，两营相去二里。