但此编的缺点亦存在不少，首先是材料繁杂，所引诸书达：五十余种，下逮欧阳修、苏轼、苏辙诸作；旁及张商英伪《三坟》等等莫不征引，故显其书参错冗杂，漫无体例，缺乏条理。另外作者的观点亦有失误之处，如吴氏认为唐韵不可析离，古韵只是唐韵几个韵部的合并或某几部间的相通等等。在一定程度上，影响了全书的学术价值。自陈振孙在《直斋书录解题》中提出朱熹撰《诗集传》时，即用此书之说后，后世诸儒便皆推崇而鲜有驳难。《四库全书总目》经考证后认为，陈氏之说有失误，朱子所用盖是其《诗补音》中部分观点，而不是此书；另外，朱子注《楚辞》时，亦取用了吴氏《楚辞释音》中的一些材料。对其舛误，明末颐炎武曾为其纠正，成《韵补正》一书，与原书互为表里。今存有明翻刻宋本，不易得见；另有熹靖元年（1522）陈风梧重刊本，分上下二卷；入清，《四库全书》亦给予收录。